Krajem 19. stoljeća Pula se razvila u najveći istarski grad i 1861. je otvorena Carsko-kraljevska Mornarička bolnica, koja je unutar svoje zgrade imala i vlastitu ljekarnu (K. u. K. Marinespital Apotheke). Muzej je 1991. godine preuzeo predmete iz te ljekarne (namještaj, stojnice, knjige i dr.) i 2005. godine, povodom 50. godišnjice od osnutka Muzeja, izložio ih na stalnom postavu. Osnovni dio postava čini originalni stilski namještaj, a mogu se još vidjeti i stojnice napunjene biljnim sirovinama, tehnička oprema za pripremu ljekovitih oblika – mužari, lončići za žarenje, tjesnac za tablete, mikroskop, vaga te gotovi komercijalni lijekovi iz farmaceutske industrije, ambalaža i pomoćni pribor za liječenje (zavoji, šprice, igle, stetoskop i dr.), koji su se upotrebljavali na području Istre i Hrvatske. 

Muzej možete posjetiti svaki radni dan od 9 do 17 sati zimi, odnosno od 8 do 21 sat ljeti. Ulaznica za odrasle je 20 kuna, za djecu 5, za grupe (10 i više ljudi), studente i umirovljenike 10 kuna, a za djecu do 5 godina i invalide ulaz je besplatan.